Zdravotnická záchranná služba se na podobné situace, jako jsou povodně připravuje dlouhodobě. A to nejen v odborné rovině, ale i materiálové a technické. Byla například zakoupena velkokapacitní sanitka, velitelské vozidlo ale také třeba elektrocentrály, záchranné vesty, obleky do vody apod. Záchranáři nejprve pomáhali s evakuací nemocnic, pak se ale situace natolik zhoršila, že bylo nutné aktivovat traumaplán. Výjezdové jednotky byly posíleny o 10 skupin.
Letečtí záchranáři se účastnili zásahů u akutně a kriticky nemocných pacientů, ke kterým se sanitky nemohly po zemi dostat. Ze zatopených domů evakuovali celkem čtyři ohrožené pacienty s využitím palubního jeřábu.
Jen během neděle, kdy byla situace nejhorší, zasahoval vrtulník u osmi misí v zatopených oblastech. Nárůst vzletů proti běžným dům byl sto procent. Pracovníci tísňové linky 155 řešili přes 2 tisíce hovorů za den. Po celém kraji pomáhali také krizoví interventi, kteří poskytovali psychickou pomoc.